Más allá de lo urbano, el informe entra también en conflictos de biodiversidad. Uno de los más relevantes es el del lobo. El Defensor del Pueblo ha recurrido ante el Tribunal Constitucional la retirada de su protección en algunas regiones, al considerar que puede vulnerar el principio de conservación basado en criterios científicos. La decisión ha reabierto el debate entre conservación y actividad ganadera, un conflicto clásico que vuelve a primer plano.
Sin embargo, la mayor parte de los conflictos ambientales que recoge el informe no tienen esa dimensión mediática. Se trata de problemas cotidianos que afectan el día a día de los españoles, como el ruido, los residuos, vertidos o deficiencias en depuración, muchos de ellos vinculados a competencias municipales.